1) Транзисторы был не фуфлыжный левак - STGW40 Исток от них отказался и я довыкупал их заказ.
...
2) Первоначально мы применяли IRGP50B60 и проблем с ними не имели. Не ужели это медленные транзисторы?
А какие именно из STGW40NC60 вы "заставили работать" вместо IRGP50B60 (там ряд версий с дописьками в конце V, V-04, WD, WD-08 и тп)? Сдаётся мне, что похоже это вообще не вариант замены.