Предположение в порядке бреда: возможно в Патоне присутствует резистивная нагрузка выхода, отсюда и меньшие выбросы на картинке.
Хотя, скорее всего на выход подано дополнительное напряжение для мониторинга выхода. Тогда условия снятия осциллограм не понятны, как заставили запустится силовую часть? Короче как всегда: картинки без описания сложно понять...